Biofilm und generelle Kontamination stellen in pharmazeutischen Reinwassersystemen eine Herausforderung dar. Es handelt sich um eine Ansammlung von Mikroorganismen, die eine schützende Schicht aus organischen Polymeren bilden. Der Biofilm enthält eine Vielzahl von Mikroorganismen aus Bakterien und Sporen, darunter auch potenzielle Krankheitserreger. Sie entstehen an Stellen, an denen Wasser und Kohlenstoff auf feste Oberflächen trifft, wobei sich Mikroorganismen an den Grenzflächen ansiedeln und zu komplexen Lebensgemeinschaften zusammenfinden. Diese Mikroben mit ihrer schützenden Schicht sind Quelle ständiger Kontamination und beständig gegenüber einer regulären Spülung mit Wasser.